Amonio junginiai yra vienas iš azoto ciklo akvariume produktų. Azoto ciklo metu jie susidaro bakterijoms skaidant įvairius baltymus, vėliau tų pačių bakterijų yra oksiduojami į nitritus, vėliau į nitratus. Amonio junginiai žuvims yra kenksmingi. Jei azoto ciklas akvariume nesutrikęs, t.y. yra pakankamai gerųjų bakterijų, akvariumas gerai prižiūrimas, tai ir amonio junginiai akvariumo vandenyje bus laiku oksiduojami ir žuvims pavojaus nesukels. Be to, priklausomai nuo pH, amonio jonai NH
4
gali virsti amoniaku NH
3
, kuris yra dar pavojingesnis žuvims: toks pat kiekis NH
4
, esant normaliam pH, yra nekenksmingas, o jei pH aukštas - nuodingas.